Na área do saneamento básico (esgotos), compete aos SMAS, o sistema em baixa, isto é, a recolha das águas residuais dos clientes, e a entrega aos colectores de recolha do sistema em alta.
A recolha e tratamento de esgotos no concelho de Tomar, tem sido motivo de grande esforço, a nível do planeamento, realização de projectos e obras. Todos eles, foram delineados pelo conjunto integrado e planificado com as obras realizadas e a realizar em alta, pela empresa Águas do Centro.
Deste modo, no seguimento da realização das obras (de emissários de transporte de esgotos e equipamento de tratamento) por aquela empresa, vão estes SMAS efectuando as obras das redes domiciliárias de recolha de esgotos domésticos, em conformidade com os estudos e projectos elaborados.